Биоинформатический анализ данных высокопроизводительного секвенирования

Учебная программа дополнительного профессионального образования «Биоинформатический анализ данных высокопроизводительного секвенирования» реализуется совместно с Компанией Кномикс.

 Курс предназначен для слушателей, которые планируют получить или повысить знания и компетенции в области биоинформатики.

Цель обучения — приобретение теоретических знаний по биоинформатике, практических навыков анализа данных протеомных и геномных экспериментов для построение системных моделей биологических процессов

Задачами обучения слушателей на курсах повышения квалификации по программе «Биоинформатический анализ данных высокопроизводительного секвенирования» являются:

- формирование навыков и опыта анализа данных Омиксных исследований, интерпретации результатов

- формирование культуры построения алгоритмов обработки биологических и медицинских данных

- формирование системного взгляда на современные исследования в области системной биологии и трансляционной медицины.

- формирование подхода к организации и проведению системно биологических исследований ориентированных на получение большого количества данных

 Содержание курса:

  1. NGS секвенирование
  2. Введение в работу с ОС Linux
  3. Сборка геномов de novo
  4. Анализ геномных сборок
  5. Картирование ридов на референсный геном, просмотр результатов.
  6. Аннотация генома
  7. Определение расстояний между множеством бактериальных штаммов.
  8. Основы филогенетического анализа
  9. Поиск SNP в геномах, их аннотация
  10. Депонирование собранного генома в GenBank